Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn7Q9Z261 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.8 ms