Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms