Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sumo3Q9Z172 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Sumo3Q9Z172 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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