Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms