Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Sh3bp5Q9Z131 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5Q9Z131 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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Sh3bp5Q9Z131 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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Sh3bp5Q9Z131 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Sh3bp5Q9Z131 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5Q9Z131 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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