Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms