Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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