Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4s1Q9WVL1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms