Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms