Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VapaQ9WV55 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms