Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn3Q9WUK7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms