Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms