Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms