Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms