Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pcm1Q9R0L6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pcm1Q9R0L6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pcm1Q9R0L6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pcm1Q9R0L6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pcm1Q9R0L6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcm1Q9R0L6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms