Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms