Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms