Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf4Q9QZS2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf4Q9QZS2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf4Q9QZS2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf4Q9QZS2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf4Q9QZS2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf4Q9QZS2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf4Q9QZS2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf4Q9QZS2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf4Q9QZS2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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