Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms