Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms