Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms