Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms