Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms