Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Opn4Q9QXZ9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Opn4Q9QXZ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Opn4Q9QXZ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Opn4Q9QXZ9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Opn4Q9QXZ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms