Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms