Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms