Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms