Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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