Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms