Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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