Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp2Q9JLK4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp2Q9JLK4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms