Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm1Q9JLF6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms