Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms