Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr10Q9JL21 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr10Q9JL21 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms