Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms