Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms