Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms