Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms