Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.1 ms