Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ube2j1Q9JJZ4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2j1Q9JJZ4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms