Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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