Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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