Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efcc1Q9JJF6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms