Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms