Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA9

Ctsr, Cathepsin R, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsrQ9JIA9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsrQ9JIA9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsrQ9JIA9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms