Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MkksQ9JI70 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MkksQ9JI70 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MkksQ9JI70 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MkksQ9JI70 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms