Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LratQ9JI60 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LratQ9JI60 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LratQ9JI60 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms