Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms