Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms