Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms